Ipinagmalaki ng Department of Transportation (DOTr) na flood-proof o hindi kayang sirain ng baha ang Metro Manila Subway.
Ayon kay DOTr Secretary Arthur Tugade, may karanasan sa mga bahaing lugar ang JIM Technology Corporation (JIMT) na isa sa mga Japanese contractors para sa proyekto.
Dagdag ni Tugade, mas matindi pa ang ginawa ng mga kontraktor sa Japan dahil kinailangan pa nilang ibaon ang mga tunnel hanggang sa ilalim ng dagat kung saan hanggang ngayon ay hindi ito binabaha.